がんゲノムデータ解析**メディカルサイエンスインターナショナル/清水 厚志/9784815730529**

販売価格
6,600円(税込み)
編著
清水 厚志
出版社
メディカルサイエンスインターナショナル
分野
 
癌・腫瘍一般

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書籍版 販売期間
2022/09/01~
JANコード
9784815730529
商品コード
9784815730529
発行 2022年9月
サイズ B5変 / 472p
ISBN 978-48157-3052-9
【編集】
清水 厚志(岩手医科大学 医歯薬総合研究所 生体情報解析部門)
坊農 秀雅(広島大学大学院 統合生命科学研究科 ゲノム情報科学研究室)

学生,院生,研究者,医師,臨床検査技師・・・
がんの解析を始めたいすべての人へ 最初の一歩をこの本から!


がんゲノム医療において不可欠な、がんゲノムのデータを解析する知識と技術が身につく、実践に即した解説書。各章とも「教科書パート」(教師役が執筆)でソフトウェアのインストールから解析データの取得、データ解析、そして結果の可視化までを学び、「再現・検証レポート」(生徒役が執筆)で実際に解析を体験。つまずいた箇所は「教科書パート」にフィードバックし再確認できる、初学者の独学に効果的な学習形式を採用。データ解析未経験者でもよくわかる必携書。

【目 次】
第1章 がんのゲノム・オミックス解析を視野に入れた検体保存方法
COLUMN 1 がんゲノム研究と倫理的・法的・社会的課題

第2章 がんのターゲットリシークエンス ―がんパネルシークエンスによる乳がん変異検出
再現・検証 とある検査技師のブラックボックスへの挑戦録
再現・検証 DRY解析初心者遺伝カウンセラーの挑戦
特別寄稿 遺伝カウンセラーが「がん患者」になるとき
COLUMN 2 がんゲノムプロファイリング検査におけるエキスパートパネルの概要と課題
COLUMN 3 がん遺伝子パネル検査の課題 ①医師の立場として
COLUMN 4 がん遺伝子パネル検査の課題 ②臨床検査会社として

第3章 がんの融合遺伝子検出 ―RNAシークエンスによるがん融合遺伝子検出
再現・検証 Macか,Windowsか,それが問題だ

第4章 がんのCNV検出 ―SNPアレイによる転移性肝がん,およびメラノーマのコピー数変異検出
再現・検証 中年も,大志を抱け―Linuxを扱うべきか扱わないべきかそれが問題だ

第5章 がんのゲノム解析 ―ロングリードシークエンサーによる肺がんゲノム構造変異検出
再現・検証 遺伝子解析? それ美味しいの? 完全門外漢によるはじめての遺伝子解析
COLUMN 5 完全ヒトゲノム配列ががんゲノム解析にもたらす恩恵
第6章 がんのGWAS ―GWASによる乳がん感受性多型の検出
再現・検証 世界で一番スマートなGWAS体験をあなたへ

第7章 がんのポリジェニックリスクスコア ―ゲノムデータから乳がんリスクスコアを計算
再現・検証 Mac初心者にもできる!できると楽しい!PRSの再現・検証
COLUMN 6 がん環境要因の疫学研究と分子疫学

第8章 がんのエピゲノム解析 ―マイクロアレイによる腎がんエピゲノム変異検出
再現・検証 R(ほぼ)初心者,EWASに挑戦―驚愕!?メチル化データによる性別推定の有用性と謎

第9章 がんのcfDNA解析 ―リキッドバイオプシーによる大腸がん変異検出
再現・検証 「血の一滴」はどれだけ「重い」―cfDNAで読みとく運命の行方
COLUMN 7 がんワクチン臨床試験の統計学的課題